MBR膜清洗是目前污水處理領域中比較常見并且有效的一種膜技術。它以紫外線等方法曝氣過濾的方式，將污水中的微生物、懸浮物等物質通過膜的過濾作用分離處理。但是在長期運行過程中，MBR膜可能會被各種雜質與微生物的殘留物堵塞導致膜通量下降，甚至造成MBR系統效率下降或停工等問題。因此，及時的膜清洗就顯得尤為重要。
首先需要判斷MBR膜是否需要清洗，當膜通量降低到原來的70%左右時就應該進行清洗了。膜通量降低主要是因為膜表面被電荷中性化及污染物的吸附而導致的，這些會降低膜的孔隙度，增加污染物的阻力，進而阻礙膜的通量。當膜通量降低的情況出現，及時采取清洗措施，既可以保持MBR系統的運行效率，又可以有效地延長膜的使用壽命。
MBR膜清洗的方法有很多，如化學清洗、物理清洗、生物清洗等。其中，化學清洗是相對較為常見的方法。化學清洗時需首先排空MBR系統中的污水，在清洗前將MBR膜的水側與空氣側都進行清洗，然后進行封閉。接著，通過添加清洗液(如NaOH、NaClO、Na2CO3等)在MBR膜中回流，使得清洗液的作用于膜的表面，起到脫除污染物的作用。最后，將MBR膜進行反沖洗，以保證清洗劑順利地被清除，使得膜的表面變得干凈。需要注意的是，在進行化學清洗中，一定要注意使用清洗劑的濃度不能過高，過高的濃度會加速MBR膜的老化，縮短膜的使用壽命。
物理清洗則是采用物理沖洗的方式，推薦使用反沖洗法。反浸泡法反響了阻止和清除孔道和污垢的幾種力量和機制，充分利用接觸和動能力，通過反向流通，用逆向氣動壓力(也可以用電磁閥控制壓縮空氣)使污水中的污染物短時間內被剝離，并通過壓縮空氣控制廢水的泡沫來保護膜的過濾孔，再通過水流清洗使得污染物被有效地清除，在操作過程中尤需注意，通過控制強度，保護膜的過濾孔。
生物清洗則是采用生物活性炭的方式，即將含有養分的有機物作為營養物質加入生物活性碳清洗水中進行處理。通過生物活性碳的微生物代謝作用去除潔凈MBR膜的有機物和無機物，去除多余的有機和無機膠囊物和復合物，并可以產生生物基因化學清洗劑，從而達到對MBR膜進行生物清洗、除臭和殺菌的目的。但是，相比于物理清洗和化學清洗，生物清洗不但技術操作相對較為復雜，而且其清洗效果不如其他兩種方法顯著。
總之，根據具體清洗效果的需求選擇不同的清洗方法是至關重要的。而對于MBR膜來說，避免過高的清洗劑濃度、適當掌控清洗劑的清洗時間，以及定期按照清洗要求開展清洗工作，則是確保MBR膜長期穩定性與高效性運行的基礎。
